MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Dawn genome

Total Repeats: 14495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022760	GAA	2	6	276933	276938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237599
3502	NC_022760	CTC	2	6	277031	277036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237599
3503	NC_022760	CGC	2	6	277049	277054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237599
3504	NC_022760	ACTTC	2	10	277105	277114	20 %	40 %	0 %	40 %	557237599
3505	NC_022760	TGC	2	6	277183	277188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237599
3506	NC_022760	GTTC	2	8	277190	277197	0 %	50 %	25 %	25 %	557237599
3507	NC_022760	AGCA	2	8	277202	277209	50 %	0 %	25 %	25 %	557237599
3508	NC_022760	TGA	2	6	277292	277297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237599
3509	NC_022760	A	7	7	277337	277343	100 %	0 %	0 %	0 %	557237599
3510	NC_022760	CCA	2	6	277367	277372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237599
3511	NC_022760	CTCAGC	2	12	277389	277400	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	557237599
3512	NC_022760	AG	3	6	277427	277432	50 %	0 %	50 %	0 %	557237599
3513	NC_022760	GA	3	6	277482	277487	50 %	0 %	50 %	0 %	557237599
3514	NC_022760	CTTGC	2	10	277524	277533	0 %	40 %	20 %	40 %	557237599
3515	NC_022760	CG	3	6	277559	277564	0 %	0 %	50 %	50 %	557237599
3516	NC_022760	TGAC	2	8	277640	277647	25 %	25 %	25 %	25 %	557237599
3517	NC_022760	CAA	2	6	277673	277678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237599
3518	NC_022760	CA	3	6	277992	277997	50 %	0 %	0 %	50 %	557237600
3519	NC_022760	TGA	2	6	278027	278032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237600
3520	NC_022760	CTG	2	6	278147	278152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237600
3521	NC_022760	T	7	7	278279	278285	0 %	100 %	0 %	0 %	557237600
3522	NC_022760	A	6	6	278295	278300	100 %	0 %	0 %	0 %	557237600
3523	NC_022760	GT	3	6	278380	278385	0 %	50 %	50 %	0 %	557237600
3524	NC_022760	GCT	2	6	278418	278423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237600
3525	NC_022760	AGC	2	6	278425	278430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237600
3526	NC_022760	ATG	2	6	278435	278440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237600
3527	NC_022760	CTG	2	6	278471	278476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237600
3528	NC_022760	TAT	2	6	278547	278552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557237600
3529	NC_022760	CTG	2	6	278650	278655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237600
3530	NC_022760	CAA	2	6	278697	278702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237600
3531	NC_022760	TGC	2	6	278765	278770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237600
3532	NC_022760	AGA	2	6	278814	278819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237600
3533	NC_022760	TG	3	6	278921	278926	0 %	50 %	50 %	0 %	557237600
3534	NC_022760	TGGTAT	2	12	278970	278981	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	557237600
3535	NC_022760	GAA	2	6	279344	279349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237601
3536	NC_022760	TGT	2	6	279358	279363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237601
3537	NC_022760	ACC	2	6	279393	279398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237601
3538	NC_022760	CAC	2	6	279416	279421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237601
3539	NC_022760	CAC	2	6	279431	279436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237601
3540	NC_022760	TCG	2	6	279534	279539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237601
3541	NC_022760	GGC	2	6	279579	279584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557237601
3542	NC_022760	CAG	2	6	279664	279669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237601
3543	NC_022760	CCG	2	6	279688	279693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237601
3544	NC_022760	GAG	2	6	279694	279699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237601
3545	NC_022760	CTG	3	9	279704	279712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237601
3546	NC_022760	AACC	2	8	279722	279729	50 %	0 %	0 %	50 %	557237601
3547	NC_022760	TCC	2	6	279748	279753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237601
3548	NC_022760	CTTTT	2	10	279826	279835	0 %	80 %	0 %	20 %	557237601
3549	NC_022760	GAC	2	6	279842	279847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237601
3550	NC_022760	CCCG	2	8	279858	279865	0 %	0 %	25 %	75 %	557237601
3551	NC_022760	GGAAC	2	10	279888	279897	40 %	0 %	40 %	20 %	557237601
3552	NC_022760	ACC	2	6	279974	279979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237601
3553	NC_022760	GTT	2	6	280019	280024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237601
3554	NC_022760	TAT	2	6	280076	280081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557237601
3555	NC_022760	ACA	2	6	280118	280123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237601
3556	NC_022760	ACC	2	6	280129	280134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237601
3557	NC_022760	CAC	2	6	280166	280171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237602
3558	NC_022760	CCT	2	6	280187	280192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237602
3559	NC_022760	CT	3	6	280233	280238	0 %	50 %	0 %	50 %	557237602
3560	NC_022760	AT	3	6	280257	280262	50 %	50 %	0 %	0 %	557237602
3561	NC_022760	GCT	2	6	280463	280468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237602
3562	NC_022760	CTC	2	6	280495	280500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237602
3563	NC_022760	C	6	6	280713	280718	0 %	0 %	0 %	100 %	557237603
3564	NC_022760	TTC	2	6	280944	280949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237603
3565	NC_022760	CTC	2	6	280963	280968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237603
3566	NC_022760	CTT	2	6	281011	281016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237603
3567	NC_022760	TGG	2	6	281064	281069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237603
3568	NC_022760	ACC	2	6	281166	281171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237603
3569	NC_022760	CTG	2	6	281201	281206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237603
3570	NC_022760	A	7	7	281218	281224	100 %	0 %	0 %	0 %	557237603
3571	NC_022760	TGC	2	6	281230	281235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237603
3572	NC_022760	GTT	2	6	281244	281249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237603
3573	NC_022760	TGC	2	6	281417	281422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237604
3574	NC_022760	GTG	2	6	281451	281456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237604
3575	NC_022760	TTG	2	6	281464	281469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237604
3576	NC_022760	TGAT	2	8	281542	281549	25 %	50 %	25 %	0 %	557237604
3577	NC_022760	GATG	2	8	281550	281557	25 %	25 %	50 %	0 %	557237604
3578	NC_022760	CAA	2	6	281630	281635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237604
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3580	NC_022760	GA	3	6	281813	281818	50 %	0 %	50 %	0 %	557237604
3581	NC_022760	T	6	6	281823	281828	0 %	100 %	0 %	0 %	557237604
3582	NC_022760	CCA	2	6	281836	281841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237604
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3584	NC_022760	TTCA	2	8	282055	282062	25 %	50 %	0 %	25 %	557237604
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3587	NC_022760	ATA	2	6	282427	282432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237604
3588	NC_022760	CAG	2	6	282507	282512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237604
3589	NC_022760	G	11	11	282515	282525	0 %	0 %	100 %	0 %	557237604
3590	NC_022760	TCA	2	6	282533	282538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237604
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3592	NC_022760	CG	3	6	282569	282574	0 %	0 %	50 %	50 %	557237604
3593	NC_022760	T	6	6	282589	282594	0 %	100 %	0 %	0 %	557237604
3594	NC_022760	AGA	2	6	282670	282675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237604
3595	NC_022760	GT	3	6	282695	282700	0 %	50 %	50 %	0 %	557237604
3596	NC_022760	TA	3	6	282716	282721	50 %	50 %	0 %	0 %	557238170
3597	NC_022760	CTA	2	6	282837	282842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557238170
3598	NC_022760	GTT	2	6	283420	283425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237605
3599	NC_022760	GGC	2	6	283484	283489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557237605
3600	NC_022760	CGC	2	6	283505	283510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237605
3601	NC_022760	CTTG	2	8	283576	283583	0 %	50 %	25 %	25 %	557237605
3602	NC_022760	TGC	2	6	283594	283599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237605
3603	NC_022760	AAGCC	2	10	283618	283627	40 %	0 %	20 %	40 %	557237605
3604	NC_022760	TGA	2	6	283675	283680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237605
3605	NC_022760	CGA	2	6	283778	283783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237605
3606	NC_022760	CGC	2	6	283807	283812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237605
3607	NC_022760	CG	3	6	283826	283831	0 %	0 %	50 %	50 %	557237605
3608	NC_022760	T	6	6	283900	283905	0 %	100 %	0 %	0 %	557237605
3609	NC_022760	TTGTTT	2	12	284055	284066	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	557237605
3610	NC_022760	AT	3	6	284111	284116	50 %	50 %	0 %	0 %	557237605
3611	NC_022760	GCA	3	9	284119	284127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237605
3612	NC_022760	ATC	2	6	284157	284162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237605
3613	NC_022760	CAT	2	6	284203	284208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237605
3614	NC_022760	TA	3	6	284281	284286	50 %	50 %	0 %	0 %	557237605
3615	NC_022760	ATG	2	6	284334	284339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237605
3616	NC_022760	CTG	2	6	284371	284376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237605
3617	NC_022760	A	6	6	284403	284408	100 %	0 %	0 %	0 %	557237605
3618	NC_022760	TAATA	2	10	284433	284442	60 %	40 %	0 %	0 %	557237605
3619	NC_022760	GAA	2	6	287681	287686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237606
3620	NC_022760	GATA	2	8	287725	287732	50 %	25 %	25 %	0 %	557237606
3621	NC_022760	A	6	6	287739	287744	100 %	0 %	0 %	0 %	557237606
3622	NC_022760	GGA	2	6	287797	287802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237606
3623	NC_022760	TA	3	6	287896	287901	50 %	50 %	0 %	0 %	557237606
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3746	NC_022760	GCT	2	6	296555	296560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237610
3747	NC_022760	GCAC	2	8	296648	296655	25 %	0 %	25 %	50 %	557237610
3748	NC_022760	TCT	2	6	296852	296857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237610
3749	NC_022760	CTC	2	6	296877	296882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237610
3750	NC_022760	TGT	2	6	296890	296895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237610
3751	NC_022760	TTA	2	6	297068	297073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557237610
3752	NC_022760	AAC	2	6	297104	297109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237610
3753	NC_022760	AC	3	6	297108	297113	50 %	0 %	0 %	50 %	557237610
3754	NC_022760	TGCT	2	8	297245	297252	0 %	50 %	25 %	25 %	557237611
3755	NC_022760	GC	3	6	297274	297279	0 %	0 %	50 %	50 %	557237611
3756	NC_022760	T	8	8	297351	297358	0 %	100 %	0 %	0 %	557237611
3757	NC_022760	AT	3	6	297366	297371	50 %	50 %	0 %	0 %	557237611
3758	NC_022760	ATC	2	6	297375	297380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237611
3759	NC_022760	TGCGA	2	10	297401	297410	20 %	20 %	40 %	20 %	557237611
3760	NC_022760	GCG	2	6	297459	297464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557237611
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3762	NC_022760	TAA	2	6	297566	297571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237612
3763	NC_022760	AGG	2	6	297585	297590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237612
3764	NC_022760	ATG	2	6	297657	297662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237612
3765	NC_022760	AGG	2	6	297667	297672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237612
3766	NC_022760	GAG	2	6	297699	297704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237612
3767	NC_022760	TAC	2	6	297775	297780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237612
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3771	NC_022760	CCA	2	6	301481	301486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237613
3772	NC_022760	GGCCT	2	10	301494	301503	0 %	20 %	40 %	40 %	557237613
3773	NC_022760	CTG	2	6	301556	301561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237613
3774	NC_022760	TGAT	2	8	301600	301607	25 %	50 %	25 %	0 %	557237613
3775	NC_022760	CAT	2	6	301614	301619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237613
3776	NC_022760	CATATA	2	12	301719	301730	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	557237613
3777	NC_022760	CCAAG	2	10	301801	301810	40 %	0 %	20 %	40 %	557237613
3778	NC_022760	CATC	2	8	301896	301903	25 %	25 %	0 %	50 %	557237613
3779	NC_022760	CGT	2	6	301904	301909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237613
3780	NC_022760	TCA	2	6	301934	301939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237613
3781	NC_022760	GCT	2	6	301954	301959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237613
3782	NC_022760	CCA	2	6	301967	301972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237613
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3785	NC_022760	CCT	2	6	302023	302028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237613
3786	NC_022760	TTG	2	6	302037	302042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237613
3787	NC_022760	GTGCT	2	10	302222	302231	0 %	40 %	40 %	20 %	557237613
3788	NC_022760	TTC	2	6	302260	302265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237613
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3807	NC_022760	GACT	2	8	303094	303101	25 %	25 %	25 %	25 %	557237613
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3850	NC_022760	CATC	2	8	305385	305392	25 %	25 %	0 %	50 %	557237613
3851	NC_022760	ACC	2	6	305393	305398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237613
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3853	NC_022760	CT	3	6	305468	305473	0 %	50 %	0 %	50 %	557237613
3854	NC_022760	GT	3	6	305677	305682	0 %	50 %	50 %	0 %	557237613
3855	NC_022760	GC	3	6	305683	305688	0 %	0 %	50 %	50 %	557237613
3856	NC_022760	GTC	2	6	305800	305805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237613
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3858	NC_022760	AGT	2	6	305891	305896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237613
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3861	NC_022760	CA	3	6	306189	306194	50 %	0 %	0 %	50 %	557237614
3862	NC_022760	CAC	2	6	306235	306240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237614
3863	NC_022760	AAC	2	6	306267	306272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237614
3864	NC_022760	AC	3	6	311034	311039	50 %	0 %	0 %	50 %	557237615
3865	NC_022760	CTG	2	6	311049	311054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237615
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3992	NC_022760	CAA	2	6	333792	333797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237621
3993	NC_022760	TAA	2	6	333930	333935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237621
3994	NC_022760	ACA	2	6	334074	334079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237621
3995	NC_022760	TGAT	2	8	334251	334258	25 %	50 %	25 %	0 %	557237621
3996	NC_022760	CTCAC	2	10	334349	334358	20 %	20 %	0 %	60 %	557237621
3997	NC_022760	AAGG	2	8	334427	334434	50 %	0 %	50 %	0 %	557237621
3998	NC_022760	GT	3	6	334481	334486	0 %	50 %	50 %	0 %	557237621
3999	NC_022760	AGC	2	6	334496	334501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237621
4000	NC_022760	AGG	2	6	334509	334514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237621

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